Japonya’daki Nara Bilim ve Teknoloji Enstitüsü (NAIST) öncülüğündeki uluslararası araştırma ekibi, Gram-negatif bakterilerin dış zarlarını oluşturan proteinleri nasıl monte ettiğini kryo-elektron mikroskobu (cryo-EM) ile moleküler düzeyde haritalandırdı. Nature Communications bülteninde yayımlanan çalışma, periplazmik şaperon SurA'nın hedef dış zar proteinlerini (OMP) β-fıçı montaj mekanizmasına (BAM) aktarırken sergilediği dinamik yapısal değişimleri ilk kez ortaya koydu.
Araştırmacılar, esnek etkileşimleri sabitlemek adına hedeflenmiş mutasyonlar ve disülfür bağları kullanarak SurA–BAM kompleksinin dört farklı yapısal anlık görüntüsünü elde etti. Analizler, protein taşıyan Core alanının BAM kompleksine kademeli olarak yaklaştığını; P1 alanının bu süreci düzenlediğini, P2 alanının ise BAM bileşeni BamE ile etkileşime girerek aktarımı sağladığını gösterdi. Bu etkileşimin bozulması dış zar proteini montajını belirgin biçimde azalttı.
Dış zarın Gram-negatif bakterilerin antibiyotik direncinde kritik bir savunma bariyeri olduğunu vurgulayan Dr. Ryoji Miyazaki, teslimat mekanizmasının aydınlatılmasının bu bariyeri zayıflatacak ve dirençli bakterilerle mücadele edecek yeni antibakteriyel hedeflerin belirlenmesini sağlayabileceğini belirtti.
KAYNAK: phys.org